СТРУКТУРНА ГЕНОМІКА РЕГУЛЯТОРНИХ ЕЛЕМЕНТІВ, ЩО ЗАДІЯНІ У БІОСИНТЕЗІ АНТИБІОТИКІВ-ІНГІБІТОРІВ БАКТЕРІЙНИХ ТРАНСГЛІКОЗИЛАЗ

2020 рік, 143 ст. Список використаних джерел містить 203 найменування. У роботі вміщено 9 рисунків та 49 таблиць.

ЗМІСТ

ПЕРЕЛІК УМОВНИХ СКОРОЧЕНЬ

ВСТУП

РОЗДІЛ 1. ОГЛЯД ЛІТЕРАТУРИ

1.1. Структура геномів

1.1.1. Розмір генома

1.1.2. Геномна геометрія та арифметика репліконів

1.1.3. Орієнтація генів

1.1.4. Синтенія: збереження порядку генів

1.2. Нуклеотидний склад геномів

1.3. Використання кодонів

1.3.1. ТТА-кодон-залежна регуляція у актинобактерій

1.3.2. Значення ТТА-кодонів у геномах роду Streptomyces

1.4. Перспективні напрями геноміки актинобактерій

РОЗДІЛ 2. МАТЕРІАЛИ ТА МЕТОДИ

2.1. Штами бактерій та плазміди

2.2. Середовища та реактиви

2.2.1. Середовища та умови культивування

2.2.2. Реактиви

2.3. Методи

РОЗДІЛ 3. РЕЗУЛЬТАТИ ДОСЛІДЖЕНЬ

3.1. Характеристика мережі регуляторних генів продуцента моеноміцинів – Streptomyces ghanaensis ATCC 14672

3.1.1. Загальна характеристика генома S. ghanaensis ATCC 14672

3.1.2. Глобальні гени-регулятори вторинного метаболізму S. ghanaensis

3.2. Біоінформатичний аналіз промоторів кластера генів біосинтезу моеноміцину

3.3. Механізми регуляції експресії кластера генів біосинтезу тейкопланіну штамом Actinoplanes teichomyceticus NRRL-B16726

3.3.1. Біоінформатичний аналіз промоторів кластера генів біосинтезу тейкопланіну.

3.3.2 Загальна характеристика генома A. teichomyceticus NRRL-B16726.

3.3.3. Дослідження ролі гена tcp28 у регуляції біосинтезу тейкопланіну.

3.3.3.1. Аналіз іn silico нуклеотидної послідовності гена tcp28.

3.3.3.2. In vivo дослідження ролі гена tcp28.

3.4. Створення веб-сервісу для біоінформатичного аналізу використання кодонів та їхнього внутрішньогенного розташування

РОЗДІЛ 4. ОБГОВОРЕННЯ РЕЗУЛЬТАТІВ ДОСЛІДЖЕНЬ

ВИСНОВКИ

СПИСОК ВИКОРИСТАНИХ ДЖЕРЕЛ

Подивитись короткий огляд роботи можна за наступним посиланням:  СТРУКТУРНА ГЕНОМІКА РЕГУЛЯТОРНИХ ЕЛЕМЕНТІВ, ЩО ЗАДІЯНІ У БІОСИНТЕЗІ АНТИБІОТИКІВ-ІНГІБІТОРІВ БАКТЕРІЙНИХ ТРАНСГЛІКОЗИЛАЗ.pptx